Probiotika können in Lebensmitteln oder Medikamenten Einsatz finden. Im Nahrungsmittelbereich gibt es zum Beispiel mit probiotischen Bakterien hergestellte Joghurts, Joghurtdrinks, Quark, Käse oder Wurst. Als probiotische Kulturen kommen in Lebensmitteln meist Milchsäurebakterien wie Bifidusbakterien- und Lactobacillus-Stämme zum Einsatz. Damit sie ihre gesundheitsförderlichen Wirkungen entfalten können, müssen sie in ausreichender Menge lebend den Darm erreichen.